Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms