Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pax5Q02650 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms