Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms