Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms