Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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