Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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