Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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