Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms