Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms