Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms