Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smg6P61406 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smg6P61406 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms