Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Romo1P60603 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Romo1P60603 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Romo1P60603 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms