Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P58686 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P58686 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P58686 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P58686 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P58686 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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P58686 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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P58686 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P58686 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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