Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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