Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Cldn18P56857 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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