Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CitP49025 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CitP49025 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms