Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms