Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms