Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tnfsf9P41274 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms