Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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