Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VhlP40338 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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