Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms