Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PpardP35396 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PpardP35396 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PpardP35396 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PpardP35396 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms