Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rab5cP35278 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rab5cP35278 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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