Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms