Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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