Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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