Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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