Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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