Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms