Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms