Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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