Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfaP20033 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfaP20033 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfaP20033 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfaP20033 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PdgfaP20033 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PdgfaP20033 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PdgfaP20033 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PdgfaP20033 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PdgfaP20033 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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