Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sdc1P18828 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms