Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18530 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P18530 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18530 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18530 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18530 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18530 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18530 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P18530 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms