Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gata1P17679 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms