Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.8 ms