Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms