Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms