Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
DmdP11531 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
DmdP11531 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DmdP11531 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms