Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl2P10889 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms