Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms