Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtaP09225 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms