Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01727 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01727 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01727 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms