Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P01655 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P01655 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms