Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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P01649 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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P01649 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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P01649 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01649 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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P01649 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01649 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01649 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01649 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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P01649 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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P01649 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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P01649 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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