Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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CcnkO88874 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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CcnkO88874 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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CcnkO88874 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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