Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cops6O88545 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cops6O88545 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms