Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rdh16O54909 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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