Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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